ระบบพิธีการศุลกากรพาณิชย์อิเล็กทรอนิกส์ (E-Commerce Customs System) เป็นระบบงานที่ให้บริการ รับ - ส่ง ข้อมูลทางอิเล็กทรอนิกส์ระหว่างผู้ประกอบการกับกรมศุลกากร ตามประกาศ ระเบียบ และหลักเกณฑ์ของ กรมศุลกากร ที่เกี่ยวข้องกับสิทธิประโยชน์ทางภาษีอากรประเภทเขตปลอดอากร โดยมี กองสิทธิประโยชน์ทางภาษีอากร (กสอ.) ของ กรมศุลกากร เป็นผู้กำกับดูแล

ผู้ประกอบการสามารถปรึกษาปัญหาทางเทคนิคที่เกี่ยวข้องกับระบบพิธีการศุลกากรพาณิชย์อิเล็กทรอนิกส์ได้ที่ ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร (ศทส.) ส่วนพัฒนาระบบส่งออกและสิทธิประโยชน์ (สพอ.) ฝ่ายระบบงานสิทธิประโยชน์ ชั้น 5 อาคาร 120 ปี กรมศุลกากร (คลองเตย)